Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms