Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms