Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnf212F6TQD1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms