Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm10477F6SW83 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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