Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syngap1F6SEU4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms