Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm20518E9Q548 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20518E9Q548 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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