Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
ApobE9Q414 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms