Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms