Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
E430018J23RikE9PZQ8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms