Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms