Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syde2E9PUP1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms