Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SafbD3YXK2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms