Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Ube2d4D3YUH6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms