Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clrn2B2RVW2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms