Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms