Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brpf3B2KF05 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms