Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PtprsB0V2N1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PtprsB0V2N1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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PtprsB0V2N1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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PtprsB0V2N1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtprsB0V2N1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms