Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm6880A3KG45 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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