Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Rtf1A2AQ19 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rtf1A2AQ19 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rtf1A2AQ19 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Rtf1A2AQ19 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms