Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms