Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms