Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Pramef6A2A8M8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pramef6A2A8M8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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