Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprfA2A8L5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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PtprfA2A8L5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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PtprfA2A8L5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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