Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calcoco2A2A6M5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms