Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms