Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Knop1Q9Z2Q2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Knop1Q9Z2Q2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms