Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vamp5Q9Z2P8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms