Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nfe2l3Q9WTM4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nfe2l3Q9WTM4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nfe2l3Q9WTM4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2l3Q9WTM4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nfe2l3Q9WTM4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nfe2l3Q9WTM4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2l3Q9WTM4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms