Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod1Q9R0E2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod1Q9R0E2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms