Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AmfrQ9R049 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms