Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms