Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpc3Q9QZC1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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