Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phtf1Q9QZ09 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms