Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rabgef1Q9JM13 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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