Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tlr5Q9JLF7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms