Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gde1Q9JL56 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms