Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ldb3Q9JKS4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms