Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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OtofQ9ESF1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OtofQ9ESF1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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