Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ms4a4bQ9ES61 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ms4a4bQ9ES61 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ms4a4bQ9ES61 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ms4a4bQ9ES61 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ms4a4bQ9ES61 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ms4a4bQ9ES61 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4bQ9ES61 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ms4a4bQ9ES61 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ms4a4bQ9ES61 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ms4a4bQ9ES61 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ms4a4bQ9ES61 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4bQ9ES61 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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