Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hipk3Q9ERH7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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