Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms