Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TnmdQ9EP64 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnmdQ9EP64 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnmdQ9EP64 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnmdQ9EP64 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TnmdQ9EP64 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms