Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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MNCb-2875Q9DCB3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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