Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn3Q9DCB1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn3Q9DCB1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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