Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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