Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms