Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smg9Q9DB90 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smg9Q9DB90 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms