Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnpy3Q9DAU1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms