Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smco2Q9DA21 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms