Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Subh2bvQ9D9Z7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Subh2bvQ9D9Z7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Subh2bvQ9D9Z7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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